農發行始終堅持以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，堅持“兩個一以貫之”不動搖，在完善公司治理中加強黨的領導，遵循各治理主體獨立運作、有效制衡、相互合作、協調運轉的基本原則，構建起了黨委全面領導、董事會戰略決策、高級管理層授權經營，權責法定、權責透明、協調運轉、有效制衡的公司治理機制，持續推進農業政策性金融治理體系和治理能力現代化。
一、農發行黨委發揮全面領導作用，把方向、管大局、保落實，保證監督黨和國家的方針、政策得到貫徹執行，在完善公司治理中加強黨的領導。
二、農發行董事會對經營和管理承擔最終責任，董事會在黨的領導下，在落實國家政策、制定經營戰略、完善公司治理、制定風險管理及資本管理戰略、決策重大項目等方面發揮戰略決策作用，監督并確保高管層有效履行經營管理職責。
三、農發行高級管理層接受黨委領導，對董事會負責。高級管理層在經營管理活動中，堅決貫徹落實黨中央、國務院的決策部署，認真執行黨委決定，按照農發行章程及董事會授權開展經營管理活動，依法合規經營，確保農發行經營發展與董事會所制定批準發展戰略、風險偏好及其他政策相一致，確保董事會決議落地生效。
